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漢語拼音是目前漢語最廣泛使用的拼音方案，儘管如此，有不少人詬病它對外國人不友好，不如威妥瑪拼音，譬如c、x、q等字母，往往被讀作/kʰ/、/kʰs/和/kʰw/。這種說法的一大問題在於，默認外國人等於以英語爲母語的西方人（英國人、美國人）。從更廣的範圍來看，漢語拼音幾乎每個字母的音都不是隨意的訓讀，而是有章可循的。

爆破音

普通話音系中，爆破音分爲送氣和不送氣兩組，分別是p、t、k和b、d、g，對應的國際音標是/pʰ/、/tʰ/、/kʰ/和/p/、/t/、/k/。由於普通話沒有濁爆破音，威妥瑪拼音沒有使用b、d、g三個字母，而是用p'、t'、k'表示送氣音，p、t、k表示不送氣音。對於三個送氣爆破音，普通話的發音和英語是完全一樣的，所以直接使用了這三個字母，沒有任何爭議之處。而對於三個不送氣爆破音，使用b、d、g事實上也是和許多日耳曼語發音一致的，因爲譬如在英語、德語中，b、d、g在單詞開頭會清化爲不送氣音，也就是/p/、/t/、/k/，和普通話一樣。至於在詞中、詞尾保留濁音，普通話中並沒有這樣的音節，所以無需關心。

軟齶擦音

普通話中有一個軟齶擦音字母h，用於表示國際音標中的/x/。這個字母在英語、德語中的發音都是/h/，而在諸羅曼語（法語、意大利語、西班牙語等）中，h更是根本不發音。/h/和/x/的發音是略有不同的，這個細節容易被普通話母語者忽略，甚至也會被英語母語者忽略，但實際上不難聽出來/h/是比/x/的摩擦程度 「弱」很多的。所以可以認爲這兩個音在漢語甚至英語中是一個音位。

使用字母h表示/x/，漢語拼音並不是創新，威妥瑪拼音也使用了h。/x/在許多斯拉夫語言中很常見，譬如塞爾維亞-克羅地亞語有兩套書寫系統，分別是西里爾字母和拉丁字母，其拉丁字母h對應的西里爾字母是х，讀音爲/x/。ISO 9西里爾字母拉丁轉寫標準中，х也被轉寫爲h。

在有/h/、/x/對立的語言中，譬如德語、波斯語，/x/往往會被寫爲ch或kh。普通話沒有這種對立，所以沒有必要放棄字母h不用而捨近求遠。俄語另一種常用的轉寫標準ALA-LC就把х轉寫爲了kh，結果就導致英語母語者把它唸成/kʰ/而不是/h/或者/x/，儘管對於英語母語者來說/x/更接近於/h/。

噝音

普通話有三個噝音s、sh、x，國際音標爲/s/、/ʂ/、/ɕ/。其中最沒有爭議就是齒齦擦音s，這個音在歐亞各個語言中都非常普遍。普通話中捲舌擦音sh和英語的sh/ʃ/略有不同，但差別不顯著，沒有音位對立。

漢語拼音字母x最有來頭，同時這個字母也讓許多英語母語者無所適從。在英語中x幾乎總是讀作/ks/，極少數時候讀作/z/。拉丁字母中x來自於希臘字母ξ/ksi/，在英語中保留了/ks/。但是x在古伊比利亞語中，發音是/ʃ/，目前的葡萄牙語中大部分x還都是/ʃ/，譬如xícara，西班牙語中也有少數詞讀/ʃ/。普通話中聲母爲x的音節的韻母都有/i/介音，而聲母爲sh的音節韻母都沒有/i/介音，兩者成了互補音位。/ɕi/和/ʃi/發音又相似，於是便借用了字母x。

值得一提的是西班牙語中許多x還唸作/x/，譬如Taxas。由於和字母j的發音相同，México又寫作Méjico。普通話中聲母爲x的字大部分都來自尖團合流前的曉母、匣母和心母，如果只看曉母、匣母（兩者合併爲/x/），就和西班牙語有異曲同工之妙了。

塞擦音

擁有大量塞擦音是漢語與西方語言最顯著的區別。普通話有三組塞擦音，都有送氣和不送氣的對立，分別是z（/ts/）、c（/tsʰ/）、zh（/tʂ/）、ch（/tʂʰ/）、j（/tɕ/）、q（/tɕʰ/）。塞擦音送氣不送氣的對立在印歐語系語言中是很罕見的，據我所知只有亞美尼亞語有這樣的特徵，因此對西方人來說這幾組音是普通話聲母最難學之處。

齒齦塞擦音z和c的對立與意大利語相似，區別在於意大利語中z是濁塞擦音/dz/，c（元音i、e前）是清塞擦音/ts/，對送氣與否不敏感，z在德語中是清塞擦音/ts/。c這個字母在古典拉丁語中讀音是/k/，不分後面的元音，但是後來發生了齶化，致使c開始分軟硬，即洪音前保留/k/不變（硬音），在細音（i、e）前變成了塞擦音/ts/（軟音），即意大利語，後來進一步變成了噝音/s/（英語、西班牙語）。值得一提的是斯拉夫諸語言和阿爾巴尼亞語中，字母c在任何元音之前都表示/ts/，譬如ulica。這可能是古代最早使用拉丁字母的斯拉夫人，在巴爾幹半島遇到了意大利人，於是把意大利語中僅有的可以表示這個音的字母借了過去。這樣斯拉夫諸語言中的c和漢語拼音中的c恰好一樣。

捲舌塞擦音zh和ch幾乎是漢語特有的，很難在歐洲語言中找到對應。ch（/tʂʰ/）和英語的ch（/tʃʰ/）近似，並且普通話和英語都不能區分兩者，所以使用得很有道理。zh應該說是漢語拼音的獨創，因爲zh在歐洲語言中大多用來轉寫/ʒ/這個音，譬如俄語護照姓名轉寫。姓張的人在聽英語母語者叫名字的時候，應該對這個音有所體會。漢語拼音zh仿造了z和c的關係，將ch不送氣化。臺灣通用拼音使用了jh這個字母組合，爲的是兼顧英語母語者發音，因爲在英語中至少j是塞擦音。

齦齶塞擦音也是普通話的一個較爲獨特的發音。漢語拼音中j用來表示不送氣的/tɕ/，q用來表示送氣的/tɕʰ/。j在英語中是一個塞擦音，與/tɕ/有相似之處，漢語拼音拿來借用。但是j在更多的語言中的發音其實是/j/，包括德語、北日耳曼語、斯拉夫諸語，如果不知道這一點，像斯洛文尼亞首都Ljubljana這樣的詞硬是按照英語發音就會變得詰屈聱牙。用q表示/tɕʰ/應該是漢語拼音最與衆不同的地方了，沒有任何其他語言中q讀作近似的音。但是這也並非隨意安排，而是有一定道理的，在漢語拼音誕生之前，曾經有過一種區分尖團音的拉丁化新文字。拉丁化新文字把尖音聲母寫作zi、ci、si，把團音聲母寫作gi、ki、xi。實際上gi、ki、xi反映了近代官話見組聲母齶化之前的發音。漢語拼音決定不區分尖團音以後，ki被讀音近似的q代替也是順理成章的。

齒齦近音

普通話中r的發音是/ɹ/或/ɻ/，這個字母在英語中讀作/ɹʷ/，與普通話的r相當接近，只是多了脣化。

順帶一提，在大部分其他歐洲語言中，r更常見的發音是/r/或/ɾ/（如意大利語、西班牙語、俄語、奧地利德語、比利時荷蘭語），這也是拉丁語對r發音的定義。但是在西歐以法國爲中心，r出現了喉音化（guttural）現象，也就是把r發作小舌擦音/ʁ/、/χ/或小舌顫音/ʀ/。這種現象的出現跟社會文化有關，從二十世紀的法國開始，齒齦顫音/r/被看成了一種沒有教養、土氣、粗俗的音，而發成小舌音則是受過教育、上流社會的象徵。這種印象至今還普遍存在於英法人的心中，例如音樂劇「歌劇魅影」中，劇院中反面角色原先女主角Carlotta在唱「Think of Me」的時候就把r發成了濃重的齒齦顫音（Youtube），而試唱的新女主角Christine則把r發成近音（Youtube），迅速博得了劇院老闆的青睞。

下圖是20世紀70年代時歐洲喉音化r的分佈地圖，深紫色爲普遍，淺紫色爲在受教育者中普遍，淺褐色爲在部分受教育者中出現，深褐色爲不常見。

其他沒有爭議的字母

剩下的幾個字母m、n、l 、y、w的發音對全世界大多數人來說都沒有什麼障礙，也沒有什麼差異。